Banca de QUALIFICAÇÃO: FLAVIA NORONHA PEREIRA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: FLAVIA NORONHA PEREIRA
DATA: 28/09/2021
HORA: 09:30
LOCAL: Videochamada
TÍTULO:

INVESTIGAÇÃO DE MUTAÇÕES NO GENE RdRp EM AMOSTRAS POSITIVAS PARA SARS-COV-2 NO ESTADO DO AMAPÁ

PALAVRAS-CHAVES:

Mutação; SARS-CoV-2; Gene RdRp

PÁGINAS: 30
GRANDE ÁREA: Ciências da Saúde
ÁREA: Farmácia
RESUMO:

Introdução: Em dezembro de 2019 um número crescente de casos de pneumonia severa e de origem desconhecida, começaram a ser diagnosticados na cidade de Wuhan, província de Hubei, China. Após notificação dos casos e análise de amostras dos pacientes, um novo tipo de coronavírus foi identificado como do gênero beta, sendo denominado de SARS-CoV-2 pelo comitê internacional de taxonomia de vírus (ICTV – International Committee on Taxonomy of Viruses) e a Organização Mundial da Saúde (OMS) nomeou a doença causada de COVID-19. Em março de 2020, a OMS declarou a COVID-19 como uma pandemia. Os vírus deRNA, incluindo SARS-CoV-2, têm altas taxas de mutação, que estão consideravelmente associadas com o aumento da virulência e da capacidade de evolução dos vírus. O gene RdRP (nsp 12) está localizado na poliproteina ORF1ab,região não estrutural do genoma tendo como função agir na replicação e transcrição  do vírus. Estudos vêm demonstrando que mutações nas proteínas RdRp e Spike podem afetar significativamente o comportamento do vírus e, portanto, a saúde humana. Diante do exposto o estudo do genoma viral dos casos positivos de COVID-19 no estado do Amapá, mais especificamente do gene RdRp através da técnica de sequenciamento de DNA por síntese é importante para investigar mutações sinônimas ou não sinônimas que possam de algum modo influenciar de forma positiva ou negativa na ação e produção de drogas e vacinas.Objetivo: Investigar a variabilidade genética no gene RdRp, sua possível influência na infectividade do vírus e na efetividade de fármacos que têm a proteína codificada pelo gene como alvo. Material e Métodos: Um total aproximado de 300 amostras oriundas do Laboratório Central do Amapá (LACEN), do banco de dados GISAID e do projeto “Testes “randomizados” de COVID-19: uma alternativa ao teste em massa para monitorar infecções por SARS-COV-2 na população do Amapá, Brasil” com resultados de PCR em tempo real positivo para infecção por SARS-CoV-2 serão
selecionadas de acordo com CT (Cycle Threshold) abaixo de 25, amostras de diferentes faixas etárias, amostras de pacientes com evolução clínica variada e amostras de diferentes regiões do estado. Será realizado a extração do RNA, e em seguida será produzido o cDNA para ser sequenciado através do sequenciador Illumina MiSeq System, sendo o gene RdRp alvo dessa pesquisa. Após o sequenciamento, será realizado o alinhamento das sequências obtidas com auxílio do software MEGA.

MEMBROS DA BANCA:
Externo ao Programa - 2042223 - EMERSON AUGUSTO CASTILHO MARTINS
Interno - 008.859.385-18 - GABRIEL ARAÚJO DA SILVA - UFRN
Presidente - 2027992 - RAFAEL LIMA RESQUE